?

Log in

No account? Create an account

Previous Entry | Next Entry

May. 30th, 2010

Большая научная конференция, ряды и ряды постеров... Поймала себя на мысли, что 90% постеров не могли быть сделаны на родине. Не только по технологическим причинам, но и по идеологическим и культурным. В том числе и потому, что на эти конференции свои постеры не представляют и не приезжают.
С российской аффилиацией был один человек .

Азиаты и европейцы присутствовали в значительном количестве.

На предыдущих конференциях, на самых разных секциях, к микрофону подходила пожилая китаянка с блокнотом и старательно задавала вопросы. Докладчики и весь зал старательно пытались понять, что она спрашивает, говорили медленно, чтобы она поняла. Думаю, что она там, просто, колонтаила, родину представляла :)

Comments

( 24 comments — Leave a comment )
olezhek
May. 31st, 2010 06:22 am (UTC)
Парочку примеров невозможных постеров, плиз! Интересно - совпадут наши с тобой мнения или нет :)
overscience_mes
May. 31st, 2010 06:24 am (UTC)
а как будем примеры представлять?
olezhek
May. 31st, 2010 06:28 am (UTC)
да не...просто я согласен что часть презентаций не может быть сделаана соотечественниками с Родины по причиние отсутствия разного.

Но хочется узнать детали твоих наблюдений. Мне про идеологические причины непонятно. Так что хочу фактов. Можно в пересказе тебя, т.е. не точные названия-содержания.
overscience_mes
May. 31st, 2010 06:30 am (UTC)
An expanding list of pathogenic bacteria and viruses have been demonstrated to target and modulate the functional properties of mitochondria, which have central regulatory roles in mammalian programmed cell death, cell cycle progression, and innate immunity. However, the mechanisms underlying pathogen-mediated modulation of mitochondria, as well as the consequences for the infected cell, remain poorly understood. Here, we characterized the mechanism by which infection with the human gastric pathogen Helicobacter pylori induces mitochondrial dysfunction and potentially mitochondria-dependent cell death. Our studies indicate that infection of human gastric epithelial cells with H. pylori results in cellular changes consistent with deregulation of normal mitochondrial dynamics. During H. pylori infection, we detected an MOI- and time dependent transition of mitochondria from a predominantly filamentous networks or matrices to small punctiform structures, suggesting an excess of mitochondrial fission, a highly regulated process, that functions normally to excise dysfunctional mitochondria from the functional network, critical for cellular proliferation and differentiation. H. pylori infection resulted in excessive activation and detectable recruitment (as detected by fluorescence microscopy) to the mitochondria of the small GTP-binding protein Drp1, which functions by assembling into fission foci at mitochondria to drive the pinching off of smaller individual dysfunctional mitochondria-derived organelles. The vacuolating cytotoxin (VacA) was demonstrated to be both essential and sufficient to activate Drp1 and disrupt the mitochondrial matrix. Inhibition of Drp1 using knockdowns or a Drp1 specific inhibitor blocked VacA-dependent mitochondrial fragmentation, as well as remodeling of the mitochondrial outer membrane and subsequent cell death, demonstrating a link between the VacA-mediated activation of Drp1 and toxin-dependent apoptosis. This is the first example of a pathogenic organism that deregulates mitochondrial structural dynamics to induce cellular dysfunction and potentially cell death.
overscience_mes
May. 31st, 2010 06:33 am (UTC)
ну кому нафиг нужна форель, когда люди мрут как мухи?
Flavobacterium psychrophilum is the causative agent of coldwater disease (CWD) and rainbow trout fry syndrome that affect many salmonid species worldwide. Outbreaks of CWD contribute to million dollar losses in commercial and conservational aquaculture every year due to direct mortalities and decreased fitness of surviving fish. There are no commercially available vaccines against CWD and use of antibiotics is not considered a long-term solution to this problem. Recently, enzyme-linked immunosorbent assay and fluorescent antibody tests were developed to screen fish, eggs and broodstock for F. psychrophilum. The monoclonal antibody used in these assays, FL-43, has 100% diagnostic specificity and high sensitivity (<104 CFU/ml) when tested against a panel of genetically diverse F. psychrophilum strains and other Flavobacterium species. We used two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis, immunoblotting and mass-spectrometry to analyze bacterial whole-cell lysates and found that FL-43 binds a protein that is ~22.7 kDa in size and with pI of 8.61; the predicted protein is annotated as FP1493 in the whole genome sequence (NCBI-GeneID: 5300029). We PCR amplified this hypothetical open-reading frame, cloned the product and expressed the protein after which we demonstrated that FP1493 is detected by monoclonal FL-43 antibody and by antisera from rainbow trout that have survived challenge with F. psychrophilum. Additional protein detection experiments have demonstrated that FP1493 synthesis by F. psychrophilum may be influenced by iron availability under both in vitro and in vivo growth conditions. We are characterizing the role of FP1493 in pathogenesis and determine the potential of this protein as a subunit vaccine.
olezhek
May. 31st, 2010 06:42 am (UTC)
Re: ну кому нафиг нужна форель, когда люди мрут как мухи?
о...теперь я понимаю о чем ты. Да, есть такой момент.

С другой стороны, на Родине желающие вовсю удовлетворяют свой уже давно покрытый мхом интерес к вопросам совершенно не имеющим отношения к жизни и нанотехнологиям:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19364326 - и лаборатория уже много лет занимается вот этими "протеиназами из бациллюса" и в этом году у них опять много грантов.

Ну вот нравится им эта тема, пусть она ну ни разу и никак не на острие науки.
overscience_mes
May. 31st, 2010 06:47 am (UTC)
Re: ну кому нафиг нужна форель, когда люди мрут как мухи?
вот, яркий пример, но не потому что никому не нужно, а потому что из всех их статей за 5 лет и одной нормальной не слепить

но слава богу, что хоть их клепают
но много денег я бы им не дала
vigna
May. 31st, 2010 07:00 am (UTC)
Это ты про микробиологическую? Странно, почему никого из России не было. Я вот на "большую научную конференцию" по своей теме собираюсь ехать :)
А микробиологи у нас тут вроде есть хорошие. Не, ну хоть бы от Скр. кто-нить съездил, про геномы термофильных архей рассказал :)
overscience_mes
May. 31st, 2010 04:37 pm (UTC)
Это, типа, считается конференцией американского общества... поэтому и не было. А то что крупнейшая в теме, то кто ж это знает. А кто знает, тот молчит. Кстати, очень много европейских постеров и докладчиков. Причем, европейцы интереснее.

Геномы бактерий сейчас читаются пачками. Подслушала разговор перед постером -- а почему бы вам не просеквенировать геном этой микробы, всего 20 тыс и все? -- Так его аннотировать придется... - зачем вам его аннотировать, вам только ваш ген нужен, остаток положите в базу данных

Я не об отсталости Родины, я о том, как быстро сейчас надо бежать, чтобы не остаться сзади... Раньше у меня был внутренний критерий, могло ли это быть сделано на родине или нет. Сейчас критерий устарел.

vigna
May. 31st, 2010 09:02 pm (UTC)
читаются пачками, а публикуются - ???
Нет, ребята вполне могли бы быть на уровне, если б захотели.
Ну и биоинформатики наши, которые занимаются бактериями чуть менее чем все. Не верю, что там не было секции по системной биологии/биоинформатике.
Может, дело в деньгах или в сложности получения американской визы?
overscience_mes
May. 31st, 2010 09:12 pm (UTC)
а публикуются - ??? -- уже появился новый жанр - краткие сообщения о геномах

Мария, чтения геномов на чужом оборудовании, это не наука, их аннотация лишь немногим более наука. У информатиков свои конференции, хотя они и были представлены на этой тоже. Системная биология - это такой же лейбл как нанотехнологии, только денег чуть меньше, зато позиций навалом.

Деньги не знаю, визы, говорят, сейчас легко дают.
vigna
May. 31st, 2010 09:23 pm (UTC)
Мария, чтения геномов на чужом оборудовании, это не наука, их аннотация лишь немногим более наука.
Как раз именно это и наука. Точнее, именно это то, из чего есть шанс появиться геномике как науке. Больше геномов, хороших и разных.

Системная биология - это такой же лейбл как нанотехнологии, только денег чуть меньше, зато позиций навалом.
ну таки я даже и не спорю :) однако, кто просёк этот тренд и сумел им воспользоваться, тот кагбэ молодец. И в этом плане зарубежные коллеги подают хороший пример.
Вообще, ловкости рук нашим не хватает. Даже академику Скр:)
*это всё не про поиск истины, если что :)*
overscience_mes
May. 31st, 2010 09:28 pm (UTC)
Больше геномов, хороших и разных. - ммм... тонем, дорогая, тонем в шелухе, накопление информации без озвученных вопросов к природе очень малоинформативно
с другой стороны, не называйте это наукой и мне будет пополам, кто как тратит деньги и время жизни убивает
vigna
May. 31st, 2010 09:35 pm (UTC)
Пока мы не видим данных, мы не можем знать, какие вопросы задавать.*
Кто-то вообще ни в грош не ставит все эти high-throughput методы, потому что накололся на данных микроэрреев, например... Кто-то, наоборот, считает секвенирование панацеей для всего, начиная от анализа экспрессии, заканчивая построением древа жизни. Правда где-то посередине.

*и этим во многим объясняется мой скептицизм по отношению к биотеоретикам
overscience_mes
May. 31st, 2010 09:37 pm (UTC)
Кто-то вообще ни в грош не ставит все эти high-throughput методы, потому что накололся на данных микроэрреев -- я недавно анализировала чужой эррей, я уже готова к этой части человечества примкнуть :)))
vigna
May. 31st, 2010 09:38 pm (UTC)
Ну дык! С микроэрреями я дела не имела, но вот реал-тайм...
overscience_mes
May. 31st, 2010 09:41 pm (UTC)
пожалуй эрреи лучше риал тайм... просто я еще столкнулась, что ребята по данным о раннем логарифме культуры сделали выводы обо всем вцелом и опубликовали в Саенс... Это меня заставило задуматься о жизни. А ведь, если бы мой белок хорошо экспрессировался в раннем логарифме, то могла бы и не задуматься.
galeolaria
May. 31st, 2010 07:32 am (UTC)
Поймала себя на мысли, что 90% постеров не могли быть сделаны на родине. Не только по технологическим причинам, но и по идеологическим и культурным.

Ну разверни уж мысль-то, раз заинтриговала :)
overscience_mes
May. 31st, 2010 04:30 pm (UTC)
Это требует времени, которого у меня в ближайшее время не будет. Но я эту мысль для Олежика проиллюстрировала, и обещаюсь к ней вернуться с примерами.
alexandra_vg
May. 31st, 2010 09:22 am (UTC)
Ой, испугалась, вроде куда приглашают, если еду, всегда пост могу сделать. Причем, несколько удивить данными, ну как все порядочные докладчики. Я правда не микробиолог.
overscience_mes
May. 31st, 2010 04:29 pm (UTC)
Пост можно сделать всегда, если б соотечественники подали абстракты, они бы с вероятностью 90% были бы приняты - отметается только явная шелуха.

Удивить я не рассматриваю, удивить это только часть проблемы. Другая часть проблемы -- методология, постановка задачи, интерпретация.
alexandra_vg
May. 31st, 2010 06:15 pm (UTC)
Ну, это, естественно есть. Собственно интерпретация полученных данных и есть результаты. А методы у нас математики отдельно докладывают, а мы суть методов и результаты отдельно. Иногда даже на разных по профилю конференциях. В общем мы себя как-то ущербно по сравнению с мировой наукой в нашем направлении не чувствуем

Edited at 2010-05-31 06:19 pm (UTC)
kilativ
May. 31st, 2010 12:24 pm (UTC)
Китаянка занималась троллингом. Троллила организаторов и участников конференции. Так принято!
overscience_mes
May. 31st, 2010 04:25 pm (UTC)
Неудачно, никто не понял :)
( 24 comments — Leave a comment )

Latest Month

October 2017
S M T W T F S
1234567
891011121314
15161718192021
22232425262728
293031    
Powered by LiveJournal.com
Designed by Ideacodes