?

Log in

No account? Create an account

Previous Entry | Next Entry

Канадский журнал прислал на рецензию китайскую статью. Китайцы из очень глубинного китая.
Случай интересный :)

Статья написана прекрасным языком, хотя и малость высокопарно. Изложение вполне логично. Магия языка оказалась настолько сильна, что я подумала - Ну вот, наконец-то мне прислали статью, которую мне сразу принять хочется.

Однако, на поверку совсем простенькая статья оказалась совсем не простой. Сильно подозреваю, что я третий ревьюер.

Что мы имеем? Ген из безобидной бактерии проклонировали в кишечной палочке и клеточные экстракты стали обладать гемолитической активностью, способностью лизировать мембраны клеток, например, крови. Это гемолизин -- заключили китайцы.

К фактическому материалу и исполнению претензий нет, все душевно, методы -- средняя российская микробиологическая лаба тихо плачет в углу.
Картинки радуют взгляд. Все стейтменты доказаны.


Но... (мои личные изыскания) у этого белка нет никакой возможности покидать клетку бактерии. Ни сигнального пептида, трансмембранный домен на уровне воображения компьютера... Зачем внутри бактериальной клетки гемолизин??? Зато есть хорошее сходство с РНК связывающими белками, и явное место для связывания донора метильных групп. Т.е. логично предположить РНК-метилтрансферазу. Структура аналогичного белка близкой бактерии решена каким-то консорциумом и доступна для всех. Там видно и место связывания донора, и РНК связывающий домен (часть белка) опознается даже моим малотренированным глазом.

Однако, много лет тому назад аналогичный белок из туберкулезной палочки записали в гемолизины на основании экспериментов, схожих с китайскими. Вполне приличные люди записали. Как этот белок может делать дырки в мембране непосредственно - я не представляю. Дырки делают экстракты клеток, в которых этот белок экспрессировался. Сам белок китайцы, почему-то не пробовали. Почему, понятно, конечно.

И еще, несколько лет тому назад я натыкалась на этот белок, он действительно регулируется ferric uptake regulator, который регулирует, в том числе, и экспрессию генов патогенности бактерий.

Вот я и думаю, что принять эту статью не получится. И дилемма, помогать ли китайцам обсуждением и просьбой дополнительных экспериментов?

Но сам детектив мне понравился... И черт, в какой-то китайской дыре нормальные методы стоят на потоке. А мне есть с чем сравнивать. Я и в штатах видела менее упакованные лабы.

Comments

( 40 comments — Leave a comment )
vls_777
Feb. 11th, 2010 07:26 am (UTC)
Непонятны твои душевные терзания
overscience_mes
Feb. 11th, 2010 07:28 am (UTC)
Да у меня нет терзаний, я думаю вслух. Я исхожу из правила -- относись к рецензируемому так, как ты бы хотел, чтобы отнеслись к твоей работе. Объективно.
(no subject) - vls_777 - Feb. 11th, 2010 07:30 am (UTC) - Expand
(no subject) - overscience_mes - Feb. 11th, 2010 07:31 am (UTC) - Expand
(no subject) - vls_777 - Feb. 11th, 2010 07:33 am (UTC) - Expand
(no subject) - overscience_mes - Feb. 11th, 2010 07:34 am (UTC) - Expand
(no subject) - vls_777 - Feb. 11th, 2010 07:36 am (UTC) - Expand
(no subject) - overscience_mes - Feb. 11th, 2010 07:44 am (UTC) - Expand
(no subject) - vls_777 - Feb. 11th, 2010 07:46 am (UTC) - Expand
_wikoli_
Feb. 11th, 2010 08:02 am (UTC)
ну, ИМХО, - так им все и напиши :)
overscience_mes
Feb. 12th, 2010 03:59 am (UTC)
Почти так и напишу :)
artx
Feb. 11th, 2010 08:11 am (UTC)
У китайцев высокий процент плагиата.
vls_777
Feb. 11th, 2010 08:21 am (UTC)
А конкретнее?
(no subject) - artx - Feb. 11th, 2010 01:12 pm (UTC) - Expand
(no subject) - overscience_mes - Feb. 12th, 2010 04:04 am (UTC) - Expand
(no subject) - artx - Feb. 12th, 2010 10:15 am (UTC) - Expand
(no subject) - overscience_mes - Feb. 12th, 2010 04:02 am (UTC) - Expand
mfreidin
Feb. 11th, 2010 09:57 am (UTC)
А мне вот российскую работу прислали. Плохая работа. Правда и журнал не ахти. Вот тут дилемма так дилемма. Вроде и помочь надо первому автору - аспиранту, а вроде ничем уже и не помочь. Не я, так второй рецензент зарубит. За державу обидно.
tankozavr
Feb. 11th, 2010 03:20 pm (UTC)
pomogite aspirantu ne priemom plohoi raboty - a delnim sovetom
(no subject) - mfreidin - Feb. 11th, 2010 03:47 pm (UTC) - Expand
(no subject) - (Anonymous) - Feb. 11th, 2010 03:57 pm (UTC) - Expand
(no subject) - overscience_mes - Feb. 12th, 2010 04:05 am (UTC) - Expand
alexandra_vg
Feb. 11th, 2010 10:33 am (UTC)
Мне тут тоже статью в российский журнал на рецензию присылали. Я ее на повторное рецензирование отправила, но подробно объяснила, что не так. Мне отдельно благодарственное письмо авторы прислали и статью прилично переделали. Приятно, и статья, хоть и не твоя, но вполне нормальная в конце-концов получилась. В общем, мир очень тесен и свой environment мы сами себе потихоньку создаем.
tryptophobe
Feb. 11th, 2010 02:38 pm (UTC)
контроли с экстрактами клеток, не содержащих этот белок, делали?
overscience_mes
Feb. 12th, 2010 04:08 am (UTC)
Делали. Я даже верю, что что-то такое в клетках синтезируется при экспрессии этого белка... Но очищенный белок они не пробовали, или, точнее, пробовали, но не привели данные. Если бы они пришли к выводу, что это не гемолизин, я бы приняла статью in its current form for publication...
(no subject) - tryptophobe - Feb. 12th, 2010 03:02 pm (UTC) - Expand
(no subject) - overscience_mes - Feb. 12th, 2010 03:09 pm (UTC) - Expand
tankozavr
Feb. 11th, 2010 03:21 pm (UTC)
konechno pomogat' esli est' vremya i shkurniye interesy ne peresekayutsya -

i tebe i obschestvu i kitaycam pol'za)
a mojet esche i moralniy benefit)) ...depends
overscience_mes
Feb. 12th, 2010 04:09 am (UTC)
Добрые у меня друзья, никто не сказал на мыло их :)
(no subject) - tankozavr - Feb. 12th, 2010 10:21 pm (UTC) - Expand
(no subject) - overscience_mes - Feb. 12th, 2010 11:54 pm (UTC) - Expand
(Anonymous)
Feb. 11th, 2010 04:29 pm (UTC)
mimo prokhodil
U menya pokhozhaya istoriya s yaponcami, tol'ko yazyk tak sebe. Ya starayus' byt' ob'ektivnym, no ne tyanet stat'ya. Prichem, v nekotorykh mestakh oni sami sebya v luzhu sazhayut. Ya by ne muchalsya s dilemmoi otnositel'no Kantovskogo imperativa.
overscience_mes
Feb. 12th, 2010 04:10 am (UTC)
Re: mimo prokhodil
Трудно реджект, особенно когда журнал так себе, сама всегда страдаю :)
(Anonymous)
Feb. 11th, 2010 09:46 pm (UTC)
It looks like there is no real question here: you do not need to
invent a bicycle.
This is a standard situation, and guidelines for dealing with it
are given everywhere, see e.g. the ACS website, ethical guidelines:
http://pubs.acs.org/userimages/ContentEditor/1218054468605/ethics.pdf
Your obligation, explicitly stated, is to point out what are the
possible sources of errors or incompleteness in this work, and to
suggest additional experiments needed to confirm/reject their ideas.
benjamin_vn
Feb. 11th, 2010 11:04 pm (UTC)
"Мама, а ты с кем разговаривала?" ©
overscience_mes
Feb. 11th, 2010 11:07 pm (UTC)
no clue
(no subject) - benjamin_vn - Feb. 11th, 2010 11:41 pm (UTC) - Expand
(no subject) - overscience_mes - Feb. 12th, 2010 04:11 am (UTC) - Expand
ua4uk
Feb. 14th, 2010 03:46 pm (UTC)
Вы,мадам,поосторожнее.не ведитесь,please!
( 40 comments — Leave a comment )

Latest Month

September 2018
S M T W T F S
      1
2345678
9101112131415
16171819202122
23242526272829
30      

Tags

Powered by LiveJournal.com
Designed by Ideacodes